Mediante una investigación basada en el minuto a minuto de ese día, "11-S, Estado de emergencia" cuenta con algunas de las entrevistas en profundidad más honestas y detalladas hechas hasta ahora a personajes como el ex asesora de Seguridad Nacional, Condoleezza Rice, el ex secretario de Defensa Donald Rumsfeld, el entonces presidente interino de la Comisión Mixta de jefes del Estado Mayor, Richard Myers, o el jefe de Gabinete de la Casa Blanca, Andrew Card. El documental pone el énfasis en los retos que estos funcionarios afrontaron para procurar mantener la calma y el control de los acontecimientos en medio de una crisis sin precedentes, y también muestra el vacío de poder que se vivió en Estados Unidos durante unos minutos que se hicieron interminables.