Stagione
Episodio
- Episodio 1: Attacco dallo spazio
- Episodio 2: Donatello nella giungla
- Episodio 3: Michelangelo alla fiera del giocattolo
- Episodio 4: I guerrieri di Marmo
- Episodio 5: La mamma di Shredder
- Episodio 6: Quattro tartarughe e una bimba
- Episodio 7: Il collezionista matto
- Episodio 8: La sostanza magica
- Episodio 9: Il pianeta delle tartarughe
- Episodio 10: La melodia che fermò Krang
- Episodio 11: Musica maestro, prego
- Episodio 12: Supereroe per un giorno
- Episodio 13: Ritorno al passato
- Episodio 14: Il ritorno della Mosca 2
- Episodio 15: Le misteriose sparizioni
- Episodio 16: Alla conquista dell'Universo
- Episodio 17: Una festa con sorpresa
- Episodio 18: Flagello la tartaruga cattiva
- Episodio 19: Cambio di personalità
- Episodio 20: I topi di canale 6
- Episodio 21: Hanno rimpicciolito Michelangelo!
- Episodio 22: L'attacco del grande Zipp
- Episodio 23: Donatello ferma il tempo
- Episodio 24: Addio Fior Di Loto
- Episodio 25: Ribelle senza pinna
- Episodio 26: Bebop e Rocksteady supereroi
- Episodio 27: Michelangelo incontra Bugman
- Episodio 28: Povera, piccola tartaruga
- Episodio 29: Bravo Michelangelo!
- Episodio 30: La Dimensione X
- Episodio 31: La laurea di Donatello
- Episodio 32: Il furto dei gemelli
- Episodio 33: Leonardo contro Tempestra
- Episodio 34: Splinter se ne va
- Episodio 35: Raffaello tassista novello
- Episodio 36: Gli incontri ravvicinati
- Episodio 37: Gli insetti giganti
- Episodio 38: La rivolta dei Soldati del Piede
- Episodio 39: Oggetto non identificato
Tartarughe Ninja alla riscossa Stagione 4 Il ritorno della Mosca 2
Quattro tartarughe cadono nelle fogne e fanno amicizia con Hamato Yoshi un giapponese mandato a New York che è stato costretto a vivere nelle fogne. Un giorno vede uno strano bagliore verde che trasforma le quattro tartarughe in creature simili agli umani. Hamato (ora Maestro Splinter) si trasforma in un ratto gigante dal bagliore verde e insegna alle tartarughe le abilità del ninja mentre fanno squadra con la giornalista April O'Neil per combattere contro l'arcinemico di Yoshi, Shredder e Krang, un signore della guerra alieno della Dimensione X.
